Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV3-15P01624 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms