Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRATO95237 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRATO95237 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRATO95237 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRATO95237 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRATO95237 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRATO95237 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms