Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOL3O95236 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms