Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KDM4BO94953 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KDM4BO94953 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KDM4BO94953 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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