Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRD4O60885 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRD4O60885 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRD4O60885 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRD4O60885 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms