Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMC8O43402 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMC8O43402 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMC8O43402 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMC8O43402 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMC8O43402 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EMC8O43402 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EMC8O43402 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMC8O43402 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMC8O43402 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMC8O43402 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMC8O43402 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMC8O43402 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMC8O43402 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EMC8O43402 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms