Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRTM2O43300 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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