Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6AO15550 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms