Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms