Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms