Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms