Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PATL2C9JE40 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms