Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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