Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOTOA8MTQ0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms