Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NL46 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NL46 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NL46 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NL46 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NL46 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NL46 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NL46 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NL46 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NL46 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NL46 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
A6NL46 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
A6NL46 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A6NL46 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A6NL46 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
A6NL46 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NL46 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NL46 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NL46 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms