Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCP1A6NGW2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCP1A6NGW2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCP1A6NGW2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCP1A6NGW2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCP1A6NGW2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCP1A6NGW2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCP1A6NGW2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRCP1A6NGW2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms