Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms