Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms