Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms