Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms