Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms