Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms