Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED16Q9Y2X0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED16Q9Y2X0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms