Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAK1Q9UPV9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAK1Q9UPV9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms