Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC12A4Q9UP95 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms