Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTF2Q9UNY4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF2Q9UNY4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms