Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms