Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms