Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNRF3Q9ULT6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms