Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms