Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms