Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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