Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APEX2Q9UBZ4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms