Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS7AQ9UBW8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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