Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RRBP1Q9P2E9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms