Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHRF1Q9P1Y6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms