Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GIN1Q9NXP7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms