Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TOR4AQ9NXH8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms