Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM106BQ9NUM4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms