Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8A2Q9NTI2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms