Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERINC1Q9NRX5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERINC1Q9NRX5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms