Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB6BQ9NRW1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB6BQ9NRW1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms