Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC31BQ9NQW1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms