Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms