Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HDAC8Q9BY41 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms