Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTDSS2Q9BVG9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms