Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GINS3Q9BRX5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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