Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USB1Q9BQ65 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms