Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPA33Q99795 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms