Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRBNQ96SW2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRBNQ96SW2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms